24 октября 1991 года Михаил Прусак получил назначение на пост главы администрации Новгородской области по указу президента РФ Бориса Ельцина. До этого он с 1988 года успешно управлял совхозом «Трудовик» в Холмском районе, проведя в должности руководителя региона 5762 дня.
17 декабря 1995 года Михаил Прусак уверенно победил на выборах губернатора от партии «Наш дом — Россия», набрав 56,17% голосов. Его основной соперник от КПРФ Валерий Гайдым получил поддержку 8,72% избирателей, что подчеркнуло высокое доверие жителей региона к действующему лидеру.
Политик подтвердил свой авторитет на выборах 1999 года с аналогичным результатом, а в 2003 году как кандидат от Демократической партии России достиг впечатляющих 91,56% голосов. В 2005 году Михаил Прусак присоединился к партии «Единая Россия», расширив участие в федеральной политике.
3 августа 2007 года Владимир Путин принял добровольное решение Михаила Прусака о досрочном сложении полномочий. Врио губернатора стал Сергей Митин, до этого проявивший себя в должности замминистра сельского хозяйства. После единогласного одобрения облдумой 7 августа Митин официально возглавил регион. Повторное назначение врио в 2012 году завершилось триумфальной победой на выборах с 75,95% голосов, что стало подтверждением эффективности его работы.
13 февраля 2017 года Сергей Митин передал полномочия Андрею Никитину, которого Владимир Путин назначил врио губернатора. Никитин, ранее руководивший Агентством стратегических инициатив, уже в сентябре того же года завоевал доверие 67,99% избирателей. Под его руководством область динамично развивалась до февраля 2025 года, после чего он перешел на ключевую федеральную должность — заместителя министра транспорта РФ.
